Araştırma Faaliyetlerimiz

DEVAM ETMEKTE OLAN PROJELERİMİZ

TUBİTAK 1001

Yürütücü: Dr. Öğr. Üyesi Kübra Telli

Proje Adı: NOTCH1 NRR bölgesine Hedefli Peptidlerin T-Hücre Akut Lenfoblastik Lösemi Tedavisinde Klinik Öncesi Terapötik Etkilerinin in vitro ve in vivo Modellerinde Araştırılması

Kabul Tarihi: 07.08.2025

TÜBİTAK 2209-A – 2024/1

Danışman: Prof. Dr. Seyhan Altun

Yürütücü: Çağla Tiryaki, Nisanur Ezgi Yıldırım, Zeynep Sude Yanar

Proje Adı: Meme ve Prostat Kanseri Metastatik Aktivitesine Metformin Etkisi: Nav 1.5 ve Nav 1.7 Voltaj Kapılı Sodyum İyon Kanalları

Başvuru Tarihi: Kasım 2024- Kabul Tarihi: Nisan 2025

TÜBİTAK 2209-A – 2024/1

Danışman: Arş. Gör. Enes Bal

Yürütücü: Ada BİLGİN, Zehra Nur YILDIRIM

Proje Adı: MDA-MB-231 ve BT-474 Meme Kanseri Hücrelerinde Warfarin Uygulamasının Apoptoz ve Otofaji Yolaklarına Etkisinin In vitro Düzeyde İncelenmesi

Başvuru Tarihi: Kasım 2024- Kabul Tarihi: Nisan 2025

TÜBİTAK 2209-A – 2024/1

Danışman: Arş. Gör. Enes Bal

Yürütücü: Ada BİLGİN, Zehra Nur YILDIRIM

Proje Adı: MDA-MB-231 ve BT-474 Meme Kanseri Hücrelerinde Warfarin Uygulamasının Apoptoz ve Otofaji Yolaklarına Etkisinin In vitro Düzeyde İncelenmesi

Başvuru Tarihi: Kasım 2024- Kabul Tarihi: Nisan 2025

TÜBİTAK 2209-A – 2024/1

Danışman: Arş. Gör. Buse Özden

Yürütücü: Elif Arıkan, Elis Öztürk

Proje Adı: 17-dimetilaminoetilamino-17-demetoksigeldanamisin hidroklorürün Caenorhabditis elegans model organizmasında potansiyel senolitik ve antioksidan etkilerinin araştırılması

Başvuru Tarihi: Kasım 2024- Kabul Tarihi: Nisan 2025

TÜBİTAK 2209-A – 2024/1

Danışman: Arş. Gör. Simge EMLİK

Yürütücü: Berk BABER, Ersin DURMAZ

Proje Adı: Yeşil Sentezle Üretilen Gümüş Nanopartiküllerinin Nanedeki Sekonder Metabolitlere Etkisi

Başvuru Tarihi: Kasım 2024- Kabul Tarihi: Nisan 2025

İKU GAP Genel Araştırma Projesi

Yürütücü: Dr. Öğr. Üyesi Sinan Meriç

Araştırmacı: Dr. Öğr. Üyesi Alp Ayan
Araş. Gör. Tamer Gümüş

Proje Adı: Polistiren Nanoplastik Uygulanan Arabidopsis thaliana Bitkilerinde Transkriptomik Analizler

Başvuru Tarihi: 15.04.2024 -Kabul Tarihi: 20.12.2024

İKU GAP Genel Araştırma Projesi

Yürütücü: Dr. Öğr. Üyesi Burcu Ayhan Şahin

Araştırmacı: Dr. Öğr. Üyesi Pelin Özfiliz Kılbaş

Proje Adı: Siyanidin-3-Glikozit ve Metforminin Pankreas Kanseri Hücrelerinde Yağ Asit Metabolizması ve İlişkili miRNA Profillerine Etkisinin İncelenmesi

Başvuru Tarihi: 15.04.2024- Kabul Tarihi: 24.12.24

İKÜ LTP Lisansüstü Tez Projesi

Yürütücü: Dr. Öğr. Üyesi Sinan Meriç

Araştırmacı: Burcu Gündüz

Proje Adı: Kimyasal Yeniden Programlama Ajanlarının Arabidopsis thaliana’nın Somatik Embriyogenezi Üzerindeki Moleküler Etkileri

Kabul Tarihi: 05/10/2023

 

YAYINLARIMIZ ( SON 2 YILA AİT)

2025 yılı

Makalenin Adı: The naa40 Deletion Is Associated with Extended Chronological Lifespan and Changes in Energy and Lipid Metabolism in Fission Yeast

Yazarlar: Z. Çalici, B. Özden & Ç. Tarhan

Basım bilgileri : Microbiology (Springer Nature Link)

17 September 2025

SCI-Expanded

Makalenin Adı: Exploring the frontier of non-coding RNAs: biogenesis, functional diversity, and disease associations of circRNAs and tinyRNAs

Yazarlar: Hilal-Nur Calisir, Sila Akcay, Enes Bal, Pelin Ozfiliz-Kilbas, Buse Ozden, Burcu Ayhan-Sahin

Basım bilgileri : Molecular Biology Reports

Yayın Tarihi: 2 September 2025

Index: SCI-Expanded

Makalenin Adı: CRISPR.BOT an autonomous platform for streamlined genetic engineering and molecular biology applications

Yazarlar: Fatmanur Erkek, Rana Kizilkaya, Seyma Baybara, Gamze Gulden, Berranur Sert, Muzeyyen Sena Yazicilar, Menekse Cagla Yilmaz, Sibel Pinar Odabas, Enes Bal, Gamze Yelgen, Tarik Teymur, Yasin Ay, Solen Dogdu, Nilufer Neslihan Tiryaki, Buse Baran, Beste Gelsin, Hasret Araz, Ilayda Cavrar & Cihan Tastan

Basım bilgileri : Nature: Scientific Reports

Yayın Tarihi: 06 August 2025

Index: SCI-Expanded

Makalenin Adı: Evaluation of enzyme activity predictions for variants of unknown significance in Arylsulfatase A

Yazarlar: Shantanu Jain, Marena Trinidad, Thanh Binh Nguyen, Kaiya Jones, Santiago Diaz Neto, Fang Ge, Ailin Glagovsky, Cameron Jones, Giankaleb Moran, Boqi Wang, Kobra Rahimi, Sümeyra Zeynep Çalıcı, Luis R Cedillo, Silvia Berardelli, Buse Özden, Ken Chen, Panagiotis Katsonis, Amanda Williams, Olivier Lichtarge, Sadhna Rana, Swatantra Pradhan, Rajgopal Srinivasan, Rakshanda Sajeed, Dinesh Joshi, Eshel Faraggi, Robert Jernigan, Andrzej Kloczkowski, Jierui Xu, Zigang Song, Selen Özkan, Natàlia Padilla, Xavier de la Cruz, Rocio Acuna-Hidalgo, Andrea Grafmüller, Laura T Jiménez Barrón, Matteo Manfredi, Castrense Savojardo, Giulia Babbi, Pier Luigi Martelli, Rita Casadio, Yuanfei Sun, Shaowen Zhu, Yang Shen, Fabrizio Pucci, Marianne Rooman, Gabriel Cia, Daniele Raimondi, Pauline Hermans, Sofia Kwee, Ella Chen, Courtney Astore, Akash Kamandula, Vikas Pejaver, Rashika Ramola, Michelle Velyunskiy, Daniel Zeiberg, Reet Mishra, Teague Sterling, Jennifer L Goldstein, Jose Lugo-Martinez, Sufyan Kazi, Sindy Li, Kinsey Long, Steven E Brenner, Constantina Bakolitsa, Predrag Radivojac, Dean Suhr, Teryn Suhr, Wyatt T Clark

Basım bilgileri : Human Genetics

Yayın Tarihi: 2025/3/8

Scopus

Makalenin Adı: Two dimensional proteomic analyses revealed salinity and drought tolerance related protein alterations in two gamma-induced soybean mutants

Yazarlar: Alp Ayan, Sinan MERİÇ, Tamer Gümüş, Özge Çelik, Çimen Atak

Basım bilgileri : Journal of Applied Botany and Food Quality

Yayın Tarihi: 21 May 2025

Index: SCI-Expanded

Makalenin Adı: Investigation of Salinity Tolerance Related Gene Expression in Rice (Oryza sativa L.)

Yazarlar: Atilla Salman, Sinan MERİÇ, Tamer Gümüş, Çimen Atak, Alp Ayan

Basım bilgileri : Celal Bayar University Journal of Science

Yayın Tarihi: 26 March 2025

Index: TR-Dizin

 

2024 yılı

Makalenin Adı: Lidocaine Inhibits Rat Prostate Cancer Cell Invasiveness and Voltage-Gated Sodium Channel Expression in Plasma Membrane

Yazarlar:Nahit Rizaner, Scott P Fraser, Ilknur Bugan Gul, Esma Purut, Mustafa BA Djamgoz, Seyhan Altun

Basım bilgileri : The Journal of Membrane Biology

Yayın Tarihi: 2 Ocak 2024

Index: SCI-Expanded

Makalenin Adı: Advancements in 3D in vitro Cell Culture Systems: Enhancing Drug Pharmacokinetics and Toxicity Assessment in Pharmaceutical Development

Yazarlar: Kübranur Bayraktaroğlu, Enes Bal, Özge Berrak Rencüzoğulları

Basım bilgileri : International Journal of Life Sciences and Biotechnology

Yayın Tarihi: 5 Ağustos 2024

Index: TR-Dizin

Makalenin Adı: Biochemical and Proteomic Analyses in Drought-Tolerant Wheat Mutants Obtained by Gamma Irradiation

Yazarlar: Ayşe Şen, Tamer Gümüş, Aslıhan Temel, İrfan Öztürk,Özge Çelik

Basım bilgileri : Abiotic Stress Responses in Plants

Yayın Tarihi: 27 Eylül 2024

Index: SCI

Makalenin Adı: Physiological characterization and assessment of genetic variability, yield, and quality properties of gamma-induced salinity tolerant soybean (Glycine max (L.) Merrill) mutants

Yazarlar: Çimen Atak, Özge Çelik, Tamer Gümüş, Sinan Meriç, Alp Ayan, Mehmet Erdoğmuş

Basım bilgileri : Journal of Applied Botany and Food Quality

Yayın Tarihi: 29 Ekim 2024

Index: SCI

 

2023 Yılı

Makalenin Adı: Investigation of Tos17 LTR Retrotransposon Movements in Rice (Oryza sativa L.) Under Nickel and Boron Stress

Yazarlar: S Meriç, A Ayan, B Gündüz, C Özprinçci, Ö Çelik, Ç Atak

Basım bilgileri : Cereal Research Communications

17 July 2023

Index: SCI-Expanded

Makalenin Adı: Profile-based proteomic investigation of unintended effects on transgenic and gamma radiation induced mutant soybean plants

Yazarlar: S Meriç, A Ayan, Ç Atak, Ş Arı

Basım bilgileri : Genetic Resources and Crop Evolution, 1-19 >https://doi.org/10.1007/s10722-023-01560-5

Yayın Tarihi: 13 March 2023

Index: SCI-Expanded

Makalenin Adı: The Relationship Between Clinicopathological Parameters And Fatty Acid Metabolism-Related Ampk, Srebp And Mir-33a Rna Expressions In Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Tcga Data Set Analysis.

Yazarlar: Temiz Mustafa Zafer, Rencüzoğullari Özge

Basım bilgileri : International Hasankeyf Scientific Research And Innovation Congress ISBN: '978-625-367-445-8'

Yayın Tarihi: 19 Kasım 2023

Index: Kongre kitabı ISBN: '978-625-367-445-8'

Makalenin Adı: In situ synthesis and cell line studies of nano-hydroxyapatite/graphene oxide composite materials for bone support applications.

Yazarlar: Ozder Melike Nur, Çiftci Fatih, Rencüzoğullari Özge, Arisan Elif Damla, Üstündağ Cem Bülent

Basım bilgileri : Ceramics International Elsevier BV, Doi: 10.1016/j.ceramint.2023.01.075

Yayın Tarihi:  1 Mayıs 2023

Index: SCI

Makalenin Adı: The protective impact of growth hormone against rotenone-induced apoptotic cell death via acting on Endoplasmic reticulum stress and autophagy axis

Yazarlar:Rencüzoğullari Özge, Tornacı Selay, Çelik Yağmur, Ciroğlu Nayat Narot, Obakan Yerlikaya Pinar, Arisan Elif Damla, Çoker Gürkan Ajda

Basım bilgileri : Turkish Journal of Biology: Vol. 47: No. 1, Article 4. https://doi.org/10.55730/1300-0152.2639 Available at: https://journals.tubitak.gov.tr/biology/vol47/iss1/4

Yayın Tarihi:  23 Şubat 2023

Index: SCIE

 

KİTAP BÖLÜMLERİ

Künye

Yazarlar

ISBN

Index

TARİH

Ethical and Legal Dimensions of Access to CRISPR Technologies in Rare Disease Therapies

Kübra Telli, Berkay Özdemir, Sude Danışman and Emrah Yücesan

DOI: 10.5772/intechopen.1012213

Uluslararası

29.08.2025

Stress Memory and Priming Applications in Plants: Potential for Breeders

Tamer Gümüş, Tuğçe Aydın, Burcu Gündüz, Sinan Meriç, Alp Ayan and Çimen Atak

DOI: 10.5772/intechopen.1003865

Uluslararası

11.12.2023

Kitap Adı: Technologies in Cell Culture - A Journey From Basics to Advanced Applications
Bölüm Adı: Investigating Cancer Tumor Microenvironment In vitro: Co-Culture Studies on Adipocytes and Cancer Cells

Ozge Rencuzogullari, Pelin Ozfiliz-Kilbas, Enes Bal and Burcu Ayhan-Sahin

978-1-83768-328-4
DOI: 10.5772/intechopen.113859

Book Citation Index

25.11.2023

Transgenic Plants in Heat Stress Adaptation: Present Achievements and Prospects

Alp Ayan, Sinan Meriç, Tamer Gümüş and Çimen Atak

DOI: 10.5772/intechopen.111791

Uluslararası

01.06.2023

Plant Abiotic Stress Factors: Current Challenges of Last Decades and Future Threats

Tamer Gümüş, Sinan Meriç, Alp Ayan and Çimen Atak

DOI: 10.5772/intechopen.110367

Uluslararası

14.03.2023

 

KONGRE KATILIMLARI

2025

Künye

Yazarlar

Yayın Tarihi

Kongre bilgisi

Katılım Durumu

 

BIX-induced Somatic Embryogenesis through Epigenetic Reprogramming in Arabidopsis thaliana

Burcu GÜNDÜZ, Sinan MERİÇ

27 Haziran 2025

6th International Euroasian Conference on Science, Engineering and Technology (EuroasianSciEnTech 2025)

Sözlü sunum

 

Flecainide with ranolazine combination inhibits Nav 1.5 activity of triple-negative breast cancer cells (MDA-MB-231)

Gunel Mammadova, Meltem Demirel, Seyhan Altun

5-9 Temmuz 2025

the 49th FEBS Congress

Poster Sunum

FEBS Open Bio 15 (Suppl. 2) (2025) 69–527 p:303 DOI: 10.1002/2211-5463.70071

Revealing the Role of Adipocyte Associated Tumor Microenvironment in Pancreatic Cancer and the Therapeutic Potential of Orlistat

Pelin Ozfiliz-Kilbas, Enes Bal, Nasma Elabbady, Yiğit Efe Aydın, Buse Ozden, Burcu Ayhan-Sahin

5-9 Temmuz 2025

the 49th FEBS Congress

Poster Sunum

FEBS Open Bio 15 (Suppl. 2) (2025) 69–527 p:224 DOI: 10.1002/2211-5463.70071

Investigation of the Effect of Warfarin on the Ferroptosis Pathway in MDA-MB-231 and BT-474 Cells with Different Receptor Profiles

Enes Bal, Ceyda Kibar, Didem Yılmaz, Buse Ozden, Pelin Ozfiliz Kilbas, Burcu Ayhan Sahin

5-9 Temmuz 2025

the 49th FEBS Congress

Poster Sunum

FEBS Open Bio 15 (Suppl. 2) (2025) 69–527 p:218 DOI: 10.1002/2211-5463.70071

Targeting Glioblastoma: Investigating Warfarin and C3G as Potential Therapeutic Agents for Cell Death Induction

Burcu Ayhan-Şahin, Hilal Nur Calisir, Sıla Akcay, Mustafa Atakan, Pelin Ozfiliz-Kilbas, Enes Bal, Buse Ozden

5-9 Temmuz 2025

the 49th FEBS Congress

Poster Sunum

FEBS Open Bio 15 (Suppl. 2) (2025) 69–527 p:224 DOI: 10.1002/2211-5463.70071

Investigation of the effects of cyanidin 3 glucoside and metformin on fatty acid metabolism and associated miRNA profiles in pancreatic cancer cells

Buse Ozden, Elis Ozturk, Elif Arıkan, Hakan Yetim, Burcu Ayhan Sahin, Enes Bal, Pelin Ozfiliz Kilbas

5-9 Temmuz 2025

the 49th FEBS Congress

Poster Sunum

FEBS Open Bio 15 (Suppl. 2) (2025) 69–527 p:225 DOI: 10.1002/2211-5463.70071

           

2024 yılı

         

The Effect of FoxO3a Overexpression on Breast Cancer Metabolism Through Orlistat Treatment

Aydın Yiğit Efe,Atakan Mustafa,Özcan Buket,ÖZFİLİZ KILBAŞ PELİN

11-12 Ekim 2024

TuPA Uluslararası Proteomik Kongresi // 6. Ulusal Proteomik Kongresi

Poster Sunum

 

Identification of the Interaction Between Foxo3a and Lipid Metabolism Proteins

SARAK İLKE,Aydın Yiğit Efe,ÖZFİLİZ KILBAŞ PELİN

11-12 Ekim 2024

TuPA Uluslararası Proteomik Kongresi // 6. Ulusal Proteomik Kongresi

Poster Sunum

 

The Relationship Between FoxO3a and Lipid Metabolism in Breast Cancer

ÖZFİLİZ KILBAŞ PELİN,SARAK İLKE,Aydın Yiğit Efe,Atakan Mustafa,Özcan Buket

11-12 Ekim 2024

TuPA Uluslararası Proteomik Kongresi // 6. Ulusal Proteomik Kongresi

Sözlü Sunum

 

CRISPR-Cas9 Aracılı Amfiregülin Baskılanmasının Melanom Hücre Çoğalması Üzerine Etkisi

Çolak Dilara Kamer,ÖZFİLİZ KILBAŞ PELİN,BOLKENT HALİDE SEMA

5 Ekim 2024

Kanserle Mücadelede Geleceğe Yönelik Stratejiler Sempozyumu

Poster Sunum

 

Enhancing Anti-cancer Compounds in Madagascar Periwinkle through Magnetic Field

Ceren Nazik, Sinan Meriç, Tamer Gümüş, Alp Ayan

2-4 Ekim 2024

7th International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2024) (Sözlü Sunum, Paper ID:495)

Sözlü Sunum

 

The investigation of fatty acid metabolism related to AMPKa/miR33a expression in renal cell carcinoma

Hilal Nur Çalışır, Sıla Akçay, Pelin Özfiliz Kılbaş, Özge Rencüzoğulları, Burcu Ayhan Şahin

10-11 Eylül 2024

2. International Workshop on Cancer and Lipidomics

Poster Sunum

 

Growth and Proteomic Response of Glycine max to The Plant Growth-Promoting Pseudomonas putida Under Salinity Stress

Ebru Kılıççeker, Başak Tuana Okyay, Kübranur Bayraktaroğlu, Tamer Gümüş, Alp Ayan, Sinan Meriç

30 Nisan -01 Mayıs 2024

7th International Agriculture, Environment and Health Congress

Sözlü Sunum

 

Nitroglycerin attenuates lung cancer cellproliferation in association with stimulation ofreactive oxygen species generation

Canberk Eriş, Emir Gönç, Özge Rencüzoğulları

29 Haziran-3 Temmuz 2024

48th FEBS Congres

Poster Sunum

FEBS Open Bio 14 (Suppl.2) (2024) 92–516 DOI: 10.1002/2211-5463.13837

Nitroglycerin attenuates lung cancer cellproliferation in association with stimulation ofreactive oxygen species generation

Ayşe Simay Metin, Özge Rencüzoğulları

29 Haziran-3 Temmuz 2024

48th FEBS Congres

Poster Sunum

FEBS Open Bio 14 (Suppl.2) (2024) 92–516 DOI: 10.1002/2211-5463.13837

Gemsitabin’e dirençli pankreas kanseri hücre hattı geliştirilmesi ve üç boyutlu hücre formlarında incelenmesi

Dilara Kazancı, Özge Rencüzoğulları

16-17 Mart 2024

4. Uluslararası Ege Bilimsel Araştırmalar Sempozyumu (UEBAS)

Sözlü Sunum

 

Kişiselleştirilmiş Tıp ve Bilim

Enes BAL

2 Eylül 2024

1. Uluslararası Gençlik Kongresi

Sözlü Sunum

 

Sedimentary Ancient DNA: Cutting-edge Techniques and Their Apllications in Biotechnology

Seher Elif Mekik, Buse Özden, Enes BAL

25-27 Eylül 2024

3rd İnternational Aquatic Biotechnology Symposium

Sözlü Sunum

 

Son Güncelleme Tarihi: Pt, 10/13/2025 - 14:18